Modelagem de Sistemas Biológicos

Sobre

Junto aos seus parceiros, esta linha de PD&I busca alvos relevantes e fármacos apropriados para o tratamento de doenças não transmissíveis e infecciosas. Por meio da bioinformática aplicada a dados de genômica, interatoma e transcriptoma, bem como de biologia computacional, com o uso de técnicas de modelagem, mecânica molecular e quântica, dinâmica molecular, docking, desenho de novo e QSAR, a linha de PD&I atua na modelagem de fármacos com base em informações clínicas dos pacientes, utilizando-se de estratégias de medicina personalizada para aprimorar o tratamento das doenças investigadas em um contexto de medicina translacional. Além de realizar a modelagem de fármacos e de biofarmacêuticos, esta linha de PD&I utiliza-se da inferência filogenética, de técnicas de banco de dados, de geoprocessamento e de análises de espectrometria de massa para identificar moléculas de interesse na biodiversidade nacional.

Projetos e produtos

  • Mapa de calor representando a distribuição geográfica de Croton floribundus no Brasil de acordo com os limites estaduais. O gênero Croton é uma importante fonte de moléculas com atividade medicinal.
  • Sub-rede de genes diferencialmente expressos em uma linhagem celular maligna de tipo triplo-negativa. Os nós representam genes, enquanto os links representam a interação entre os genes.
  • Modelagem tridimensional de um fármaco na fenda da proteína HSP90AB1, um importante alvo para o tratamento do câncer. A proteína é representada em tons de cinza e o fármaco no centro, em vermelho e azul.

atividades

Junto aos seus parceiros, a linha de PD&I conta com o entendimento tecnológico para responder a perguntas nos campos de bioinformática (genômica, filogenia, transcritômica, metabolômica, interatômica), sistema de informação geográfica (SIG) e biologia computacional, bem como em modelagem matemática. A atuação diversificada da linha de PD&I favorece a integração com atividades de parceiros mais especializados, permitindo o domínio de tecnologias de bancada, e com o ensino de pós-graduação. A visão da linha de PD&I é promover atividades que favoreçam a articulação com o setor corporativo para permitir uma melhor integração dos alunos no ambiente profissional.

Equipe

  • Nicolas
    Carels
    Nicolas
    Carels
    Coordenador do Laboratório de Modelagem de Sistemas Biológicos do CDTS. Acumula conhecimentos em genética, biotecnologia e bioinformática de sistemas vegetais. Atualmente, se dedica à modelagem e bioinformática de redes moleculares de doenças para busca de alvos moleculares relevantes no contexto da terapia de precisão.
  • Carlyle
    Ribeiro Lima
    Carlyle
    Ribeiro Lima
    Físico, mestre em biotecnologia e doutor pela Universidade Paris Diderot, com ênfase em modelagem molecular de alvos terapêuticos. Atualmente desenvolve pesquisa na área de modelagem de proteínas-alvo para desarticulação da rede celular cancerígena da linhagem MDA-MB-231 de mama e investigação de reposicionamento de fármacos ativos.
  • Gilberto
    da Silva
    Gilberto
    da Silva
    Matemático pela Universidade Federal do Rio de Janeiro, mestre em Sistemas e Computação pelo Instituto Militar de Engenharia e doutor em Ciências pelo Instituto Oswaldo Cruz/ Fiocruz. Atua na curadoria de banco de dados de plantas que apresentam interesse terapêutico.
agario agario unblocked yohoho yohoho unblocked slitherio unblocked agario unblocked agario unblocked games io games unblocked slither.io unblocked slope unblocked 1v1.lol unblocked snake game cookie clicker unblocked retro bowl unblocked yohoho unblocked github yohoho.io yohoho