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Ciência translacional

Oncologia translacional

A área da Oncologia Translacional do CDTS transforma conhecimentos sobre a biologia do câncer em soluções inovadoras para prevenção, diagnóstico, prognóstico e tratamento da doença. Atuamos em colaboração com oncologistas, pacientes, serviços de saúde e parceiros institucionais, aproximando a pesquisa científica das necessidades da saúde pública.

Por meio do Centro Integrado de Pesquisa em Oncologia Translacional (CIPOT), mantemos conexão direta com a assistência oncológica e acesso a dados clínicos e materiais biológicos de pacientes brasileiros. Essa integração permite desenvolver pesquisas alinhadas às particularidades da população do país e contribuir para uma das maiores bases nacionais de informações clínicas e genômicas em oncologia.

Nossas pesquisas se concentram na identificação e validação de alterações moleculares associadas ao desenvolvimento e à progressão de tumores, com foco em doenças agressivas e de difícil tratamento, como a leucemia linfoide aguda de células T (LLA-T), o glioblastoma e o adenocarcinoma ductal pancreático (PDAC). Para isso, integramos biologia molecular e celular, bioinformática e modelagem computacional, incluindo análise de redes de interação proteína-proteína e aprendizado de máquina, além de estratégias de nanomedicina para o desenvolvimento e a caracterização de novos alvos e abordagens terapêuticas.

Também desenvolvemos e aplicamos modelos experimentais avançados, como sistemas in vitro e ex vivo, organoides, modelos tridimensionais e bioimpressão 3D, para investigar a biologia tumoral e avaliar o potencial de novos compostos e estratégias diagnósticas e terapêuticas.

Além da pesquisa experimental, promovemos a articulação entre pesquisadores e instituições nacionais e internacionais, fortalecendo redes de colaboração e criando oportunidades para o desenvolvimento conjunto de soluções inovadoras em oncologia.

Principais projetos

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Biópsia líquida e inteligência artificial do câncer de mama triplo-negativo (CIPOT)

O projeto do CIPOT busca desenvolver um método minimamente invasivo, baseado em biópsia líquida, para identificar células tumorais circulantes (CTCs) no sangue de pacientes com câncer de mama triplo-negativo.

Para isso, combina biomarcadores já identificados pelo grupo com modelos de inteligência artificial, capazes de detectar e caracterizar essas células.

Essa abordagem pode contribuir para o acompanhamento da resposta terapêutica, a identificação precoce de recidivas e a detecção de doença residual mínima, ampliando as possibilidades de monitoramento individualizado das pacientes e apoiando decisões clínicas mais precisas.

Responsáveis pelo projeto: Tatiana Tilli e Mariana Caldas Waghabi

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Da matemática à aplicação biológica: identificação e validação de novos alvos terapêuticos em cânceres agressivos por meio de ciência de redes, homologia persistente e aprendizado de máquina

O projeto busca identificar genes com potencial terapêutico em cânceres agressivos, a partir da análise de redes de interação proteína-proteína específicas do câncer (OncoPPINs) e de suas propriedades topológicas. As redes são construídas a partir de dados reais de expressão gênica de pacientes e de linhagens celulares.

Por meio da estratégia de Ataque e Impacto, cada gene é removido individualmente da rede, e o impacto dessa remoção na organização da rede é avaliado com métricas de Ciência de Redes.

Os genes que mais desestruturarem a rede ao serem removidos são considerados de maior potencial terapêutico. Esses genes são então validados experimentalmente, e os resultados alimentam modelos de aprendizado de máquinas para identificar alvos mais promissores.

Responsável pelo projeto: Flávia Carneiro

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Desenvolvimento de nanopartículas para o tratamento de Leucemia Linfóide Aguda de células T (LLA-T)

A LLA-T (Leucemia Linfoblástica Aguda de Células T) é um tipo de leucemia agressiva e heterogênea (ou seja, varia muito entre pacientes) e atinge adultos e crianças. Os tratamentos atuais são longos e tóxicos, o que reforça a necessidade de terapias mais direcionadas, capazes de reduzir efeitos colaterais, tempo de internação e procedimentos invasivos.

O projeto busca desenvolver um mecanismo de entrega de moléculas de siRNA para alvos já validados em laboratório, utilizando nanopartículas funcionalizadas para aumentar sua estabilidade, internalização e direcionamento.

Essa abordagem abre caminho para estratégias terapêuticas mais seletivas e personalizadas ao modular diretamente a expressão de genes-chave, especialmente aqueles que não apresentam potencial de ligação adequado para pequenas moléculas.

Responsável pelo projeto: Flávia Carneiro

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Terapias avançadas contra tumores sólidos malignos: nanomedicina, silenciamento molecular de RNAs não codificantes e imunomodulação do microambiente tumoral

O projeto desenvolve estratégias de terapias avançadas para tumores sólidos malignos, com foco em RNAs não codificantes associados à progressão tumoral e no microambiente tumoral. Para isso, integra três frentes complementares: o silenciamento molecular de RNAs não codificantes, a nanomedicina para entrega de moléculas terapêuticas e a imunomodulação do microambiente tumoral. Juntas, essas estratégias buscam interferir em mecanismos moleculares que sustentam a progressão tumoral e potencializar respostas antitumorais. A abordagem integra biologia celular e molecular, nanotecnologia e imunologia para o desenvolvimento e a avaliação de soluções terapêuticas com potencial de aplicação em oncologia de precisão.

Responsável pelo projeto: Ana Emília Goulart

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Anticorpos biespecíficos para tratamento do câncer de mama triplo-negativo

O câncer de mama triplo-negativo (TNBC) é um dos subtipos mais agressivos da doença, ainda com opções terapêuticas limitadas.

O projeto busca desenvolver uma nova estratégia baseada em anticorpos biespecíficos conjugados a fármacos citotóxicos, voltada ao tratamento do câncer de mama triplo-negativo (TNBC), um dos subtipos mais agressivos da doença, ainda com opções terapêuticas limitadas.

As moléculas são projetadas para reconhecer simultaneamente células tumorais de TNBC, por meio de biomarcadores específicos já identificados pelo grupo, e células T, por meio do receptor CD3.

Essa abordagem combina direcionamento tumoral, entrega seletiva de fármacos e ativação do sistema imune, buscando aumentar a eficácia terapêutica e superar mecanismos de resistência ao tratamento.

Responsável pelo projeto: Tatiana Tilli

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BRA1000: oncômica brasileira (CIPOT)

O BRA1000 é uma iniciativa do CIPOT voltada à caracterização oncômica (conjunto de dados genômicos e moleculares do câncer) da população brasileira, reunindo dados clínicos, epidemiológicos e moleculares de pacientes com câncer de mama e de pulmão.

O projeto busca construir uma das maiores bases nacionais de informação genômica em oncologia, permitindo investigar características moleculares dos tumores em diferentes populações brasileiras. Esses dados podem contribuir para identificar biomarcadores, compreender particularidades da doença no país e gerar evidências para estratégicas de diagnóstico, prevenção e tratamento mais adequadas à realidade brasileira.

A iniciativa também busca fortalecer a pesquisa translacional e ampliar a participação do Brasil na geração de conhecimento em oncologia de precisão.

Responsáveis pelo projeto: Tatiana Tilli e Mariana Caldas Waghabi

Responsáveis pela área