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Esta linha de PD&I visa à identificação, quantificação e caracterização de biomoléculas que apresentem possíveis propriedades terapêuticas, que possam atuar como biomarcadores em processos fisiopatológicos, ou que tenham importância em pesquisas de cunho biotecnológico. Para tal, utiliza-se a espectrometria de massas como cerne nas análises de larga escala, ditas ômicas.
A abordagem ômica tem ampla aplicação nos estudos que visam à identificação de biomarcadores em amostras biológicas provenientes de pacientes, além de possibilitar a caracterização e validação dessas biomoléculas para o seu uso clínico ou biológico.
Essa abordagem é potencialmente útil em diversas áreas da pesquisa clínica e das ciências translacionais, entre elas: diagnóstico, evolução da patologia, monitoramento de resposta à terapia, predição de desfecho clínico, classificação de subtipos de doenças, determinação de riscos, diferenciação de vias metabólicas, quantificação de alvos moleculares e aplicação terapêutica. Assim, caracterizar moléculas candidatas a esses fins pode impactar diretamente o desenvolvimento de produtos e processos imprescindíveis à saúde pública.
Atividades
Proteômica:
- Shotgun proteomics – identificação e quantificação em larga escala de peptídeos provenientes de misturas complexas de proteínas em diferentes amostras biológicas;
- Targeted proteomics (PRM e SRM) – quantificação de peptídeos e proteínas previamente selecionados;
- PTM proteomics – identificação e quantificação de modificações pós-traducionais em proteínas;
- Top-down proteomics – identificação e quantificação de proteoformas únicas através da análise de proteínas intactas;
- Structural proteomics – utilização de técnicas como cross-linking, HDX, proteólise limitada e modelagem estrutural, associadas à espectrometria de massas, para inferência sobre a estrutura tridimensional de proteínas.
Metabolômica:
- Imageamento de metabólitos por espectrometria de massas – análise de metabólitos feita diretamente em tecidos biológicos, onde é possível, por meio de correlação com microscopia, visualizar a localização dos metabólitos identificados dentro do tecido, possibilitando assim a relação com o estado biológico estudado (por exemplo, com/sem doença, antes/após tratamento);
- Metabolômica global – análise da composição de metabólitos de uma amostra;
- Metabolômica direcionada – análise de classes específicas de metabólitos presentes em uma amostra.
Esta linha de PD&I pode trabalhar em conjunto com outras linhas de PD&I do CDTS (por exemplo, highthroughput screening, câncer, neurociências, doenças negligenciadas) no âmbito da biologia de sistemas (integração de diferentes ômicas). Também pode participar de projetos da Fiocruz que envolvam abordagens ômicas que demandem essencialmente análises em espectrometria de massas ou outras ferramentas analíticas (por exemplo, cromatografia).